多肽计算器软件说明

1.序列输入可以单字母输入,比如序列:Ala-Cys-Asp-Glu-Phe-Gly,也可以输入ACDEFG。对于特殊氨基酸,可使用其缩写,但需要用-进行间隔,比如序列:Ala-Cys-Asp-Glu-Phe-Gly-Ser(PO3H),也可以输入ACDEFG-pS。对于D型氨基酸,比如D型Ala,可以输入DAla。
2.关于特殊氨基酸的标示方法,点击此处
3.对于酰胺键成环序列,可以在成环处加入Cyclo。比如序列Glu-Cys-Asp-Glu-Phe-Lys首尾成环,可以输入Cyclo(Glu-Cys-Asp-Glu-Phe-Lys)或Cyclo(ECDEFK),并在下面选择“主链成环”。
4.对于硫醚键,比如卡贝缩宫素:Butyryl-Tyr(Me)-Ile-Gln-Asn-Cys-Pro-Leu-Gly-NH2 (Sulfide bond between Butyryl-4-yl and Cys),可以输入Cyclo(Butyryl-Tyr(Me)-Ile-Gln-Asn-Cys)-Pro-Leu-Gly-NH2,或输入Cyclo(Butyryl-Tyr(Me)-IQNC)PLG-NH2并在下面选择“硫醚成环”。
5.为了更好的判断序列,建议特殊序列采用三字母序列进行输入。
6.对于输出的溶解性:溶解性1:可以指导你进行溶解性实验;溶解性2:只判断是否可溶于水,由于采用更严格的判断条件,部分水溶性样品的判断结果是“水溶性不确定”。
7.更多序列举例,点击此处