合成难度预测说明

软件使用说明
1.本软件只预测采用普通原料进行Fmoc固相逐步合成法的合成难度。对采用液相法、Boc法进行合成时,使用本软件进行预测,其准确度不理想。
2.对于环化、S5烯键成环、形成二硫键、硫醚键等特殊结构,本软件不能进行难度预测。但能预测形成特殊结构前的线性肽合成难度。如果采用先形成特殊结构再继续合成线性肽的方法,后续氨基酸的合成难度预测偏差较大。
3.预测时,从C端往N端第五个氨基酸开始预测合成难度,部分侧链不预测合成难度。
4.进行难度预测时,只需要输入序列即可。序列输入举例,点击此处

为何要预测合成难度
1.合成难度分为:极易连接、易连接、难连接、较难连接、极难连接。
2.对于极易连接和易连接的氨基酸,如果批量生产,可以按程序连接后不进行茚三酮等检测,直接进行后续连接。
3.对于难连接的氨基酸必须进行茚三酮等检测。
4.对于极难连接或连续较难连接的氨基酸,建议采用特殊连接方式或特殊原料进行合成,避免合成失败。
5.对于序列超过20个氨基酸的多肽,建议进行难度预测,避免因合成失败而影响客户的实验进程。

困难序列合成策略
1.更换树脂类型。比如采用PEG-PS树脂。也可以降低树脂取代度来改善合成难度。
2.合成中引入辅助序列及前序列。
3.合理的片段缩合。
4.酰胺N上的临时取代。
5.更换高活性的缩合剂。
6.采用高离液序列添加剂。
7.加入破坏β结构稳定性的溶剂及同向混合。(HMPA、DMSO、NMP、DMF;HFIP、苯酚、TFA、AcOH、EtOH)
8.改善树脂的溶胀状况。
9.利用微波合成技术。